北京師范大學第三附屬中學肇始于1959年。學校前身為北京市第一二三中學，1998年增加牡丹園校區，2003年合并海淀區文慧園中學，于2006年12月3日更名為北京師范大學第三附屬中學。是一所以人文為特色、注重全面發展的完全中學，海淀區高中示范學校、海淀區新品牌學校，北京市“1+3”項目試點校。
北京師范大學第三附屬中學占地60余畝，學校包括北校區、南校區和牡丹園校區。
建校60年來，學校秉承“愛國進步、誠信質樸”的優良傳統和“厚德勤學守正拓新”的校訓精神，形成了“一·生·和”的育人理念和“培養全面發展、和而不同的人”的育人目標，構建起了“三級五類”課程體系。北師大三附中是北京市課程建設先進學校。
學校有一支師德高尚、治學嚴謹、拼搏進取、敢于創新、團結協作的教師隊伍，涌現出多名特級教師、市區級學科骨干教師和北京市“紫禁杯”班主任稱號獲得者。英語、物理、語文教研組被評為海淀區學科基地。
學校緊扣時代脈搏，銳意改革創新，堅持以立德樹人為根本。以學業求發展、以正氣塑人格、以創新育人才。不斷開發學生特長，培育多類型人才已成為我校突出的辦學特色，科技活動、藝術社團、特色體育等均已形成規模并在全市有較大的影響力，在市區各項特色辦學評比中屢獲殊榮。多種形式的選修課一直受到學生們的青睞。學校為國內外高校輸送了大批優秀畢業生，為國家培養了數以萬計優秀的建設者和接班人。
北師大三附中與北京師范大學等高校開展了以教師培訓、課程建設、課堂診斷、課題研究、朋輩活動等深度合作，為學校的特色發展打下更為堅實的基礎。
歷經60年的發展，學校已建成為一所現代化學校，向著“雅氣和暉·東方明珠”的辦學目標不斷邁進。
